锥虫病：冈比亚的锥虫病在苏丹南部传播。在干燥季节游客感染该病的可能性增加。游客应采取各种措施防止采采蝇的叮咬。

霍乱：据报道霍乱在这个国家十分猖獗，但是对游客威胁较小。霍乱疫苗主要是针对生活、工作在卫生条件较差的高发区的人们。

在出入境任何国家之前注射霍乱疫苗并非官方要求。尽管如此，有时一些国家还是需要那些来自受霍乱威胁国家的游客出示一份接受霍乱疫苗的证明。

皮肤性利什曼病：该病在苏丹许多地区流行。流行地区包括达尔福尔、科尔多凡、以及苏丹中部一些省份以及沿尼罗河的一些地区。所有到这些地区的游客应采取各措施防止沙蝇叮咬。

登革热：登革热病例主要发生在苏丹沿海地区。该国的其他虫媒病包括白蛉热、克里米亚半岛-刚果出血热以及西尼罗河热。

肝炎：肝炎在苏丹对游客构成的小威胁较大。我们建议所有以前未注射过甲肝疫苗的旅游者都接种甲肝疫苗。在苏丹的所有人口中乙肝病毒携带者的比率为12%-19%。我们建议游客接种乙肝疫苗。旅游者还应注意，该国有些省份有戊肝爆发。

利什曼病：内脏性利什曼病在努尔人族等苏丹南部地区流行。内脏性利什曼病还在苏丹其他许多省份流行。

疟疾：疟疾在该国整年流行。流行的地区包括所有城市地区。在6-10月的雨季游客感染疟疾的可能性增加。在苏丹最北部的一些沙漠地区游客感染疟疾的可能性比较小。

所有的旅游者都应当采取措施避免叮人害虫在白天黑夜的叮咬。预防叮咬的方法包括在皮肤表面涂含有DEET溶液的驱蚊剂，将Permethrin喷洒在衣物和帐篷的表面，在晚上睡觉的时候使用Permethrin处理过的蚊帐。

脑膜炎：该病在苏丹流行，在中部与南部的省份游客感染脑膜炎的可能性增加。我们建议将要和当地人接触的游客接种脑膜炎疫苗。

其他疾病和威胁：艾滋病（流行情况不严重）、非洲扁蚤伤寒、普鲁氏菌病、包虫病、丝虫病、罗阿丝虫病、麻风病、细螺旋体病、盘尾丝虫病、弓形体病、沙眼、伤寒、肠感染等疾病以及蛇、蜈蚣、蝎子与黑寡妇蜘蛛等动物与昆虫的威胁。

狂犬病：狗传播的狂犬病在该国流行，流行地区包括乡村地区。我们建议到该国长期旅行的游客接种狂犬病疫苗。

血吸虫病：该并在苏丹广泛流行。所有游客应避免在淡水湖、池塘、小溪中游泳、洗澡或跋涉。

游客的痢疾：在苏丹该病对游客的威胁较大。该国的水源通常是污染的并带有病菌。

所有的游客都应注意饮食卫生。我们建议使用含有4-氯苯基-4羟基（依母第氨）苯醌抗生素治疗急性痢疾。如果抗生素对痢疾无效，那有可能是由寄生虫疾病引起的。例如贾第鞭毛虫病、阿米巴病、侵袭肠的疾病。

黄热病：该病在苏丹流行猖獗。我们建议所有的游客都接种黄热病疫苗。